Esistono due versioni del circuito stampato della scheda di gioco per Metroid Fusion: la prima versione è priva di batteria mentre la seconda versione dispone di batteria. L’aggiunta della batteria, nella versione più recente del circuito, è dovuta al fatto che questa utilizza chip SRAM per i salvataggi e necessita di alimentazione elettrica per mantenerli, a differenza della versione precedente, dotata di chip EEPROM che non ne necessita. Se si può scegliere, naturalmente, è preferibile la prima versione, priva di batteria.